Nos écoles sont la principale raison pour laquelle de nombreuses familles s'installent à Mercer Island. Avec un lycée, un collège, quatre écoles élémentaires et un lycée alternatif, le district scolaire de Mercer Island a une tradition d'excellence.
Grâce à des résultats aux tests standardisés parmi les plus élevés de l'État, à l'implication active des parents et à une population très instruite, les écoles de l'île ont un taux de réussite très élevé. Le taux d'abandon est en fait proche de zéro, en partie grâce au Crest Learning Center, un lycée alternatif qui accueille des élèves ayant des styles d'apprentissage différents ou des exigences d'emploi du temps particulières. Plus de 90 % des diplômés du lycée de Mercer Island poursuivent leurs études à l'université.
La Mercer Island Schools Foundation collecte des fonds pour les écoles publiques et sert de modèle aux autres fondations d'écoles publiques de l'État.
L'école Sainte-Monique est une école catholique qui accueille 250 élèves de la maternelle à la huitième année. L'école franco-américaine de Puget Sound est à la fois une école de langues bilingue et de type immersion, qui accueille actuellement environ 225 élèves. La Northwest Yeshiva High School est un lycée juif orthodoxe privé qui compte environ 130 élèves.
Il existe plusieurs autres petites écoles accréditées par l'État et des sociétés de conseil pédagogique sur l'île qui proposent des évaluations, des cours particuliers et des cours crédités dans toutes les matières jusqu'au lycée.