Nuestras escuelas son la razón más importante por la que muchas familias se mudan a Mercer Island. Con una escuela secundaria, una escuela intermedia, cuatro escuelas primarias y una escuela secundaria alternativa, el Distrito Escolar de Mercer Island tiene una tradición de excelencia.
Debido a que los puntajes de las pruebas estandarizadas se encuentran entre los más altos del estado, la participación activa de los padres y una población con un alto nivel educativo, las escuelas de la isla tienen una tasa de graduación muy alta. La tasa de deserción escolar es prácticamente nula, en parte gracias a Crest Learning Center, una escuela secundaria alternativa que atiende a estudiantes con diferentes estilos de aprendizaje o requisitos de horario especiales. Más del 90 por ciento de los graduados de Mercer Island High School asisten a la universidad.
La Fundación de Escuelas de Mercer Island recauda dinero para las escuelas públicas y sirve como modelo para otras fundaciones de escuelas públicas en el estado.
La escuela St. Monica es una escuela católica que atiende a 250 estudiantes desde el jardín de infantes hasta el octavo grado. La escuela franco-americana de Puget Sound es una escuela de idiomas bilingüe y de inmersión que actualmente atiende a unos 225 estudiantes. La escuela secundaria Northwest Yeshiva es una escuela secundaria judía ortodoxa privada con una matrícula de aproximadamente 130 estudiantes.
Hay otras pequeñas escuelas acreditadas por el estado y empresas de consultoría educativa en la Isla que ofrecen evaluación, tutoría y cursos para obtener créditos en todas las materias hasta la escuela secundaria.